第二就是要理清中国足协和国务院体育部门的关系，中国足协今后将会成为代表中国参加国际足球组织的唯一的合法机构，同时它的主要职责还包括像团结和联系全国的足球力量，推广足球运动，培养足球人才，制定行业标准，发展和完善足球注册体系，建设和管理国家队伍，包括代表国家参加各类的足球赛事。

第三就是足协与体育组织脱钩的改革过程中，要按照党关干部的原则，积极稳妥地做好相关人员的岗位转换安排。首先，足球中心的领导班子成员将会作为国务院体育行政部门的代表进入中国足协工作，免去事业单位职务，按照国家有关规定进行管理；第二，目前足球中心的在编在岗人员将会根据个人意见一次性选择去留，选择进入足协工作，将把所有的关系转入到中国足协，原来在编在岗的级别职务全部定档封存，不进入中国足协工作的由组织系统内部来统一安排，足协目前的聘用人员将会履行合同，根据脱钩改革的原则和实际情况进行完善。

除此之外，方案还提出优化执委会结构的说法，其中最重要的是减少政府体育公司代表，增加行业的、特别是联赛的组织代表，经济界、法律界、社会人士的代表，未来地方足球协会任免的地方足球体育行政部门的代表，将不再担任中国足协的职业。